Utilizo purrr ::: iwalk de esta manera, pero no hace lo que quiero:
purrr:::iwalk(DGE_tables, ~ .x[-which(.x$column1 %in% VectorOfSpecificValues),])
DGE_tables es una lista de marcos de datos. En esto, todos los marcos de datos quiero eliminar filas que tienen valores específicos en la columna1. Los marcos de datos tienen la misma estructura.
¿Es posible hacer eso con purrr ::: iwalk ? ¿O hay una mejor manera de hacerlo?
EDITAR : un ejemplo:
La lista de trama de datos:
DGE_tables
# Display
$dataframe1
column1 column2
1 to_delete 56
2 to_keep 45
$dataframe2
column1 column2
1 to_delete 78
2 to_keep 27
...
Así que quiero eliminar filas que tienen $ column1 = "to_delete". Me gusta esto:
# wanted result
$dataframe1
column1 column2
1 to_keep 45
$dataframe2
column1 column2
1 to_keep 27
...
3 respuestas
Una opción sería filter
library(tidyverse)
map(DGE_tables, ~ .x %>%
filter(column1 != "to_delete"))
#[[1]]
# column1 column2
#1 to_keep 45
#[[2]]
# column1 column2
#1 to_keep 27
O con slice
map(DGE_tables, ~ .x %>%
slice(which(column1 != "to_delete")))
O también se puede hacer con base R
lapply(DGE_tables, subset, subset = column1 != "to_delete")
NOTA: El conjunto de datos del OP es un list de data.frame y necesita una salida de retorno a list de data.frame s con un subconjunto de filas
Y no funcionaría con keep o discard
purrr::keep(DGE_tables, ~ .x[['column1']] == 'to keep')
Error: las funciones de predicado deben devolver un solo
TRUEoFALSE, no un vector lógico de longitud 2
Datos
DGE_tables <- list(structure(list(column1 = c("to_delete", "to_keep"),
column2 = c(56L,
45L)), class = "data.frame", row.names = c("1", "2")), structure(list(
column1 = c("to_delete", "to_keep"), column2 = c(78L, 27L
)), class = "data.frame", row.names = c("1", "2")))
purrr tiene keep() y discard() solo para este tipo de cosas:
library(purrr)
l <- list(
list(col1 = 'to keep', col2 = 1),
list(col1 = 'to discard', col2 = 2)
)
purrr::keep(l, ~ .x[['col1']] == 'to keep')
#> [[1]]
#> [[1]]$col1
#> [1] "to keep"
#>
#> [[1]]$col2
#> [1] 1
purrr::discard(l, ~ .x[['col1']] == 'to discard')
#> [[1]]
#> [[1]]$col1
#> [1] "to keep"
#>
#> [[1]]$col2
#> [1] 1
Hay algunas cosas en el trabajo aquí. Como no tengo tus datos (¿todavía?), Haré los míos, de manera bastante cruda:
dge <- list(mtcars[1:5,], mtcars[1:5,])
Algunos problemas:
Por definición,
purrr::walkypurrr::iwalkdevuelven el marco original.x, independientemente de lo que haga en el bloque de funciones . Como ejemplo, mira esto:(purrr::iwalk(dge, ~ return(NULL))) # [[1]] # mpg cyl disp hp drat wt qsec vs am gear carb # Mazda RX4 21.0 6 160 110 3.90 2.620 16.46 0 1 4 4 # Mazda RX4 Wag 21.0 6 160 110 3.90 2.875 17.02 0 1 4 4 # Datsun 710 22.8 4 108 93 3.85 2.320 18.61 1 1 4 1 # Hornet 4 Drive 21.4 6 258 110 3.08 3.215 19.44 1 0 3 1 # Hornet Sportabout 18.7 8 360 175 3.15 3.440 17.02 0 0 3 2 # [[2]] # mpg cyl disp hp drat wt qsec vs am gear carb # Mazda RX4 21.0 6 160 110 3.90 2.620 16.46 0 1 4 4 # Mazda RX4 Wag 21.0 6 160 110 3.90 2.875 17.02 0 1 4 4 # Datsun 710 22.8 4 108 93 3.85 2.320 18.61 1 1 4 1 # Hornet 4 Drive 21.4 6 258 110 3.08 3.215 19.44 1 0 3 1 # Hornet Sportabout 18.7 8 360 175 3.15 3.440 17.02 0 0 3 2(Si solo hace
purrr::iwalk(dge, ...)sin los parens circundantes, no verá nada porque el valor predeterminado es devolver el valor de retorno invisiblemente . Los parens obligan a que sea visible).Entonces, el punto difícil aquí es que su ejemplo de simplemente filtrar dentro de
iwalkno funcionará. Para eso, probablemente quieraspurrr::imap. (Si está haciendo más y el pequeño ejemplo en su pregunta era un fragmento más corto de más código, entonces probablemente todavía sea bueno coniwalk).Tiendo a preferir no usar
whichen bloques como ese, ya que la ausencia de negación dewhichpuede ser problemática (el vector vacío negativo no hace "nada") . En cambio, sugiero usar vectores lógicos y no vectores enteros.Ejemplos: probaré un estúpido condicional de
1 %in% 2, que obviamente no debería encontrar nada (y con su negación, devolver todas las filas):dge[[1]][ -which(1 %in% 2), ] # [1] mpg cyl disp hp drat wt qsec vs am gear carb # <0 rows> (or 0-length row.names)El uso de un vector lógico en su lugar (y
!en lugar de-) devuelve lo que esperamos (es decir, todas las filas):dge[[1]][ !(1 %in% 2), ] # mpg cyl disp hp drat wt qsec vs am gear carb # Mazda RX4 21.0 6 160 110 3.90 2.620 16.46 0 1 4 4 # Mazda RX4 Wag 21.0 6 160 110 3.90 2.875 17.02 0 1 4 4 # Datsun 710 22.8 4 108 93 3.85 2.320 18.61 1 1 4 1 # Hornet 4 Drive 21.4 6 258 110 3.08 3.215 19.44 1 0 3 1 # Hornet Sportabout 18.7 8 360 175 3.15 3.440 17.02 0 0 3 2
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